Memperoleh Ijazah Sarjana Muda dalam Farmasi dari Universiti Strathclyde pada tahun 1999 dan kemudian bekerja di farmasi komuniti dan hospital kerajaan. Pada tahun 2004, beliau melanjutkan pengajian ke peringkat PhD di Institut Farmasi dan Sains Bioperubatan Strathclyde, Scotland, dan berjaya menamatkannya pada tahun 2008.

Sepanjang kerjayanya, beliau memimpin pelbagai projek penyelidikan yang dibiayai oleh agensi dan kementerian. Kepakarannya dalam bidang ini telah diiktiraf dengan pelbagai geran industri untuk latihan Amalan Pengilangan Baik (GMP). Beliau telah menyertai lebih daripada 30 persidangan antarabangsa dan menerbitkan lebih daripada 30 kertas kerja dalam jurnal bereputasi. Prof. Farahidah juga telah menyelia lebih daripada 17 pelajar sarjana dan PhD.

Sebagai Penyelidik Utama, beliau telah memperoleh geran penyelidikan berjumlah RM 2.4 juta untuk sembilan projek. Fokus penyelidikan beliau adalah pada reka bentuk dos yang menggabungkan ubat moden dengan produk semula jadi atau tradisional, dengan tujuan mewujudkan kesan sinergistik, mengurangkan ketoksikan, dan meningkatkan kepatuhan rawatan. Lima produk hasil penyelidikan beliau telah berjaya dikomersialkan dengan jumlah hasil sekitar RM 6 juta.

Beliau telah menerima pelbagai anugerah, termasuk Anugerah Emas di Malaysia Technology Expo dan Anugerah Khas dari ISPE (Malaysia Chapter) atas inovasinya dalam membangunkan produk farmaseutikal yang lebih mesra alam. Prof. Farahidah juga sering dijemput sebagai penceramah di pelbagai platform termasuk Kementerian Kesihatan dan acara antarabangsa.

Beliau mempunyai pengalaman luas dalam pengeluaran farmaseutikal, termasuk sebagai Ketua Jabatan Pengeluaran dan Pemangku Ketua Pegawai Eksekutif di IKOP Pharma Sdn. Bhd. Beliau juga pernah memegang jawatan Timbalan Pengarah di Pejabat Pemindahan Teknologi IIUM.

Pada tahun 2022, Prof. Farahidah melancarkan produk kopi herba “STEKO” untuk menurunkan berat badan dan mengasaskan “ObiReverse”, sebuah Program Penglibatan Komuniti yang mempromosikan bahawa obesiti boleh diatasi.

Pada Mei 2023, beliau dinaikkan pangkat ke Profesor penuh, mengiktiraf sumbangan dan kepakarannya dalam bidang farmasi dan sains bioperubatan. Beliau terus menyumbang kepada peningkatan kesihatan dan mempromosikan amalan yang lestari terutama dalam bidang pencegahan penyakit.